A. Le système de fichier FAT

Windows 2000 prend en charge deux version du système de fichiers FAT : La FAT16 et le FAT32.

Le système de fichier FAT à été conçu pour les disques de petite taille et pour les structure de dossier simple. Le principal avantage du système de FAT32 tient dans sa capacité à prendre en charge des partitions plus volumineuse que la FAT16.

FAT16 : Taille max des partitions : 2 Go en pratique et 2 Go pour un fichier.
FAT32 : Taille max des partitions : 2047 Go en théorie et 32 Go en pratique, 2 Go pour un fichier.

B. Le système de fichiers NTFS

Le système de fichier NTFS prend en charge l'ensemble des fonctions de Windows 2000, notamment les point de re-analyse , la fonction NSS (enregistrement de fichier activeX) et les quotas de disque (permet à l'administrateur de définir l'espace disque mise à disposition des utilisateurs sur un serveur). NTFS gère également les fichiers éparpillés.

Il prend en charge le système de fichier CDFS, le format UDF et les périphériques de stockage DVD.

NTFS permet également de gérer de façon efficace la sécurité et les droits d'accès. Un serveur doit être partitionné en NTFS pour pouvoir passer en contrôleur de domaine.